Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms