Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms