Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms