Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms