Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HltfQ6PCN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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