Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Papd7Q6PB75 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms