Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgb4Q6P8W9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms