Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms