Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms