Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam222bQ6P539 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms