Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casc4Q6P2L7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms