Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms