Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms