Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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CltbQ6IRU5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CltbQ6IRU5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CltbQ6IRU5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CltbQ6IRU5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CltbQ6IRU5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CltbQ6IRU5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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