Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt40Q6IFX3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt40Q6IFX3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt40Q6IFX3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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