Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9bQ6EBV9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms