Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca2Q6DIC0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms