Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn1Q6A0D4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms