Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep290Q6A078 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cep290Q6A078 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cep290Q6A078 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cep290Q6A078 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cep290Q6A078 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep290Q6A078 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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