Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms