Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pdzrn3Q69ZS0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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