Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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