Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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