Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9aQ68FE2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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