Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms