Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms