Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q66JV7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q66JV7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q66JV7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q66JV7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q66JV7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q66JV7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q66JV7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q66JV7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q66JV7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms