Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knl1Q66JQ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Knl1Q66JQ7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms