Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms