Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt12Q64291 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms