Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp248Q640N4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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