Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms