Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TsnQ62348 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TsnQ62348 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TsnQ62348 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TsnQ62348 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TsnQ62348 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TsnQ62348 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TsnQ62348 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TsnQ62348 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TsnQ62348 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms