Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5dQ62240 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms