Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Ttf1Q62187 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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Ttf1Q62187 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Ttf1Q62187 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Ttf1Q62187 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Ttf1Q62187 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ttf1Q62187 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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