Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3cQ62181 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms