Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbm38Q62176 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rbm38Q62176 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rbm38Q62176 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rbm38Q62176 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rbm38Q62176 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rbm38Q62176 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbm38Q62176 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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