Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhocQ62159 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhocQ62159 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms