Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Odf1Q61999 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Odf1Q61999 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Odf1Q61999 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Odf1Q61999 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Odf1Q61999 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Odf1Q61999 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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