Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms