Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Lrrn1Q61809 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Lrrn1Q61809 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrn1Q61809 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms