Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms