Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msi1Q61474 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msi1Q61474 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms