Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms