Protein–RNA interactions for Protein: Q61327

Slc6a3, Sodium-dependent dopamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a3Q61327 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a3Q61327 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a3Q61327 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms