Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcp1Q61233 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms