Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc9a1Q61165 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9a1Q61165 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms