Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms