Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms