Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms